少正卯这个人物出现在典籍中，最早应该是《荀子·宥坐》第二十八篇，里面提到“夫少正卯，鲁之闻人也，夫子为政而始（先）诛之，得无失乎？”。“司马迁《史记。孔子世家》云：“（鲁）定公十四年，孔子年五十六，由大司寇行摄相事……于是诛鲁大夫乱政者少正卯。”也就是说，孔子在鲁国由司寇代行宰相职务才七天，就杀死当时鲁国的大夫少正卯，理由是少正卯兼有五种恶行，并且在家里聚众成群，鼓吹邪说，哗众取宠，已是小人中的雄杰，所以非杀不可。后来的《尹文子》、《说苑》、《孔子家语》等书，都引用《荀子》的说法，认为孔子杀了少正卯。

然而，南宋朱熹认为，孔子并没有杀少正卯。此说一出，许多学者表示赞同。其主要理由是：一，诸子百家著作中寓言居多，不足为信。成书早于《荀子》的《左传》、《国语》、《论语》、《孟子》等，都没有提到这件事，而且《左传》、《国语》往往对孔子有所诬罔，也不提此事，可见历史上没有孔子诛杀少正卯的事。二，孔子代行宰相职务才七天，以一个大夫的身份去杀掉另一个大夫，这是不可能做到的。三，孔于提倡仁，坚决反对轻易杀人，当鲁大夫提出“杀无道以就有道”的想法时，孔子表示反对。杀少正卯一事，与孔子的一贯思想不相吻合。

孔子诛少正卯事被考证为非，具可参崔述《洙泗考信录》、钱穆《先秦诸子系年》，论证甚详。史记中谬误、可疑之处，何止《孔子世家》一文？至于《孔子家语》，更是汉朝庸儒窜撮而成，后人一引再引，遂以为是。春秋之际，诸侯杀一大夫亦大难事，何况以大夫诛大夫，更何况以七日之速诛之？此事《春秋》不载，《左传》不论、《论语》不传。再读申韩之作，用语极其相近，譬如一人或一党之惯用语、口头禅，另一人、另一党不用，信乎刑名之徒扣“屎帽子”于孔夫之也！然诛或未诛，非予所关注。予所惊愕者，乃为从文中隐见文革之余绪。陈寅恪曰：“凡著中国古代哲学史者，其对于古人之学说，应具了解之同情，方可下笔。”呜呼，吾国最大之人格分裂，其根莫不由于阶级、唯物学说起，此学说不仅杀、而且诛心，多少才智之士颠沛流离、人头落地，遂至于士子噤口不言，文化元气斫伤殆尽。殷鉴不远，王动兄得无深察乎？