清真寺是文莱人的灵魂，也是生活中最重要的地方。在斯里巴加湾有两座著名的清真寺，分别是赛夫丁清真寺和博而基亚清真寺。前者是老国王生前建造的，也是最气派、最具地位的宗教圣地。博而基亚清真寺则是现任苏丹建造的，也是文莱最大的皇家清真寺。于1994年当今苏丹生日那天正式开放。

据说，清真寺很大，从外面看，淡蓝色的柱子高耸入云，共有29个金碧辉煌的圆顶，全是用纯金包裹的，它们是为了纪念历史上29个苏丹统治的朝代，4个189英尺高的尖塔装饰着蓝色和白色的马赛克，室外的8个立柱顶端也装饰着许多24K的金星。

寺内有两个祈祷大厅，男女两个朝拜室分别能容纳3500人和1000人。男祈祷厅的水晶镀金吊灯重达3．5吨。具有马来传统风格的镀金镂空外墙使整个清真寺庄严肃穆。朝拜室里面的设施全部电子化。