扬州市木偶剧团的前身为江苏省泰兴县木偶剧团、扬州地区木偶剧团，1983年更名为扬州市木偶剧团。

剧团阵容整齐、实力雄厚。主要编导人员有焦锋、郑平等。主要演艺人员有华美霞、薛家余、颜育、许虹、肖学明、蒋海龙、刘锦芳、张宏亮、王芸、殷大宁、朱林、王正宇、封宝义等。经过历代艺人的艰辛努力和不断探索提高，以“不是真人，胜似真人”的艺术特色而享誉海内外。

剧团拥有独具匠心的保留节目35个，主要演出剧目有传统戏《徐策跑城》、《火焰山》、《猪八戒出世》等，创作和改编的剧目有 《小虎卖瓜》、《东海小哨兵》、《孙悟空三打白骨精》、《嫦娥奔月》、《琼花仙子》、《聪明的兔子》、《曹冲称象》、《武松打虎》、《皇帝的新装》、《童女斩蛇》、《三个糊涂虫》、《司马光砸缸》等。为适应国际交流的需要，剧团专门创排了《小小银球传友谊》、《鹤与龟》、《胖子与蚊子》、《木偶车技》、《龙舞》、《扇子舞》、《长绸舞》、《狮子舞》等。其中《嫦娥奔月》获1981年全国木偶皮影戏汇演演出奖，《金鸡冠的公鸡》1984年获全国儿童剧录像评比金猴奖，《琼花仙子》1997年获江苏省第二届戏剧节优秀剧目奖和13项单项奖，1998年《琼花仙子》又荣获文化部第八届文华新剧目奖和文华导演奖、文华音乐创作奖、文华表演奖。

剧团先后出访日本、伊朗、澳大利亚、巴基斯坦、美国、韩国、厄瓜多尔、哥伦比亚、玻利维亚、秘鲁、西班牙、法国、荷兰、比利时、意大利、俄罗斯等国家及香港、台湾地区，参加了一系列重大的国际及地区艺术活动。1990年至1995年剧团和日本影法师剧团合作演出大型木偶剧《三国志》达6年之久，演出940余场，在日本国引起轰动。